上海交通大学控制科学与工程博士后流动站设于上海交通大学电子信息与电气工程学院自动化系，是1985年首批获准建立的博士后科研流动站。从建立以来，本流动站已招收博士后100余人，目前在站博士后7人。在2005年的评估中，本流动站被评为全国优秀博士后流动站。

本流动站所在的控制科学与工程一级学科中，控制理论与控制工程、模式识别与智能系统均为国家重点学科。学科点现有教授23+3人、副教授38+2人，分属“先进控制与自动化系统研究所”、“复杂系统与控制理论研究所”、“机器人与智能信息处理研究所”、“模式识别与图像处理研究所“、“燃料电池研究所”五个研究所，以及空天科学技术研究院的“信息与控制研究所”，主要研究方向包括复杂系统控制理论、生产过程智能控制与优化、智能机器人、大型过程和装备的监测与控制系统、目标识别与跟踪、智能信息处理与融合、智能交通系统、医学图像处理与手术导航、遥感遥测与空间信息系统、先进制导与控制等。

在国家211和985工程建设支持下，本学科在教学、科研方面都出现了质的飞跃。近5年来，学科承担各类科研项目实到经费9700万元，其中国家自然科学基金47项、863、973计划19项、国家科技攻关和国防“十五”项目8项，国际合作项目10项。发表论文1907篇，其中国际学术刊物243篇，SCI收录356篇，EI收录791篇，ISTP收录170篇，申请专利164项，已授权43项，获软件著作权24项。科研成果获省部级科技进步奖13次。学科已培养博士201人，硕士539人，目前在校博士生314人，硕士生565人。5年中共接待海外学者208人次来访，做学术报告115个，并主办或协办国际学术会议5次。本学科已成为我国控制领域开展高水平科研、培养高层次人才的重要基地。

目前，本学科根据国家经济建设和社会发展的需要，针对控制应用领域扩展所产生的新特点，正在围绕系统控制和信息处理的若干前沿方向，加强实验基地和环境的建设，为在总体上成为具有国际先进水平的研究基地而努力。

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