上海交通大学管理科学与工程博士后流动站设于上海交通大学安泰经济与管理学院，属于管理科学与工程一级学科。

上海交通大学管理科学与工程学科前身为系统工程学科点，由张钟俊院士、吴健中和王浣尘教授等倡导建立，1981年获得硕士学位授予权，1985年获得博士学位授予权，同年（与本校自动控制学科联合）被批准设立博士后流动站，1995年被评为上海市重点学科，1997年学科目录调整为管理科学与工程，有管理学院相关力量加入，1998年独立建立该学科博士后流动站，2002年被评为国家重点学科。相关的研究单位有复杂性研究所，电子政务研究所，管理信息系统研究中心，金融工程研究中心，产业经济与技术创新研究中心，应用统计研究所，交通运输研究所，中国都市圈发展与管理研究中心。

本流动站的研究领域和方向包括：产业组织理论、金融工程、复杂系统优化理论与方法、系统科学与系统工程、项目投资融资决策、社会经济系统复杂性态、技术管理与创新、供应链与物流、工程管理、运输系统规划与管理、信息管理与信息系统、发展经济学等。