上海交通大学数学博士后流动站于2001年初正式建立并对外接受博士后进站工作,于2003年获得数学一级学科博士点, 2007年应用数学学科列入国家重点培育学科，自2010年数学学科排名进入全球学术ESI前1％。研究方向主要包含：代数、偏微分方程理论及其应用、常微分方程与动力系统、组合数学与图论、数论、复分析及其应用、数学物理、概率论与数理统计、应用概率统计与金融数学、科学与工程计算、运筹学与控制论、应用物理与计算神经科学等，分别属于基础数学、应用数学、计算数学、概率论与数理统计、运筹学与控制论等五个二级学科。
本学科点目前拥有专职教师及研究人员共117名，包括中科院院士1名，国家杰出青年基金获得者4人，优秀青年科学基金获得者3人，青年拔尖人才获得者3名，国家教学名师1名，上海市教学名师2名，。所有这些教师都有指导硕士研究生、博士研究生或博士后的经验。目前在研的国家自然科学基金项目57项（其中主持53项），55岁以下的教授均主持国家自然科学基金项目。
本流动站已培养了一批优秀的博士后，目前已正常出站26人，在站研究人员22人。他们正成为一支重要的科研骨干力量，对促进科学研究与学科建设，改善和优化师资队伍作出积极贡献。
